Νέες εργαστηριακές μελέτες υποστηρίζουν αμφιλεγόμενο ισχυρισμό ότι τα γονίδια SARS-CoV-2 μπορούν να ενσωματωθούν στο ανθρώπινο DNA
Εργαστηριακές μελέτες γενετικά τροποποιημένων ανθρώπινων κυττάρων δείχνουν ότι το RNA (μπλε) του SARS-CoV-2 θα μπορούσε να μετατραπεί σε DNA σε μολυσμένα άτομα και να γλιστρήσει στα χρωμοσώματά τους.
Μια ομάδα διακεκριμένων επιστημόνων έχει διπλασιάσει την αμφιλεγόμενη υπόθεσή της ότι τα γενετικά κομμάτια του πανδημικού κοροναϊού μπορούν να ενσωματωθούν στα χρωμοσώματά μας και να παραμείνουν πολύ μετά την ολοκλήρωση της λοίμωξης. Αν έχουν δίκιο - οι σκεπτικιστές έχουν υποστηρίξει ότι τα αποτελέσματά τους είναι πιθανώς εργαστηριακά αντικείμενα - οι παρεμβάσεις θα μπορούσαν να εξηγήσουν το σπάνιο εύρημα ότι οι άνθρωποι μπορούν να ανακάμψουν από το COVID-19, αλλά στη συνέχεια να είναι θετικοί για το SARS-CoV-2 ξανά μήνες αργότερα.
Ο βιολόγος βλαστικών κυττάρων Rudolf Jaenisch και ο ειδικός ρύθμισης γονιδίων Richard Young του Ινστιτούτου Τεχνολογίας της Μασαχουσέτης, ο οποίος ηγήθηκε του έργου, πυροδότησε μια καταιγίδα στο Twitter τον Δεκέμβριο του 2020, όταν η ομάδα τους παρουσίασε για πρώτη φορά την ιδέα σε προπαρασκευή στο bioRxiv. Οι ερευνητές τόνισαν ότι η ενσωμάτωση ιών δεν σήμαινε ότι τα άτομα που ανέκαμψαν από το COVID-19 παραμένουν μολυσματικά. Ωστόσο, οι επικριτές τους κατηγόρησαν ότι προκάλεσαν αβάσιμους φόβους ότι τα εμβόλια COVID-19 που βασίζονται στο αγγελιοφόρο RNA (mRNA) θα μπορούσαν κάπως να αλλάξουν το ανθρώπινο DNA. (Οι Janesich και Young τονίζουν ότι τα αποτελέσματά τους, τόσο πρωτότυπα όσο και νέα, σε καμία περίπτωση δεν υπονοούν ότι αυτά τα εμβόλια ενσωματώνουν τις αλληλουχίες τους στο DNA μας.)
Οι ερευνητές παρουσίασαν επίσης μια δέσμη επιστημονικών κριτικών, μερικές από τις οποίες ασχολείται με την ομάδα σε μια εφημερίδα που κυκλοφόρησε στο διαδίκτυο σήμερα από τα Πρακτικά της Εθνικής Ακαδημίας Επιστημών ( PNAS ) «Έχουμε πλέον σαφή στοιχεία ότι οι αλληλουχίες κοραναϊού μπορούν να ενσωματωθούν στο γονιδίωμα», λέει ο Jaenisch.
Ο SARS-CoV-2, ο ιός που προκαλεί το COVID-19, έχει γονίδια που αποτελούνται από RNA, και οι Jaenisch, Young και συν-συγγραφείς υποστηρίζουν ότι σε σπάνιες περιπτώσεις ένα ένζυμο σε ανθρώπινα κύτταρα μπορεί να αντιγράψει τις ιογενείς αλληλουχίες στο DNA και να τα ολισθήσει τα χρωμοσώματά μας. Το ένζυμο, αντίστροφη μεταγραφάση, κωδικοποιείται από στοιχεία LINE-1, αλληλουχίες που απορρίπτουν το 17% του ανθρώπινου γονιδιώματος και αντιπροσωπεύουν αντικείμενα αρχαίων λοιμώξεων από ρετροϊούς. Στην αρχική τους εκτύπωση, οι ερευνητές παρουσίασαν στοιχεία δοκιμαστικού σωλήνα ότι όταν ανθρώπινα κύτταρα καρφώθηκαν με επιπλέον στοιχεία LINE-1 μολύνθηκαν με τον κοροϊό, οι εκδόσεις DNA των αλληλουχιών του SARS-CoV-2 τοποθετήθηκαν στα χρωμοσώματα των κυττάρων.
Πολλοί ερευνητές που ειδικεύονται στα στοιχεία LINE-1 και άλλα «retrotransposons» θεώρησαν ότι τα δεδομένα ήταν πολύ λεπτά για να υποστηρίξουν τον ισχυρισμό. «Αν θα είχα αυτά τα δεδομένα, δεν θα είχα υποβάλει καμία δημοσίευση εκείνο το σημείο», λέει ο Cedric Feschotte του Πανεπιστημίου του Cornell, ο οποίος μελετά ενδογενή κομμάτια ρετροϊού στο ανθρώπινο γονιδίωμα. Αυτός και άλλοι είπαν επίσης ότι περίμεναν εργασία υψηλότερης ποιότητας από επιστήμονες του διαμετρήματος του Jaenisch και του Young. Σε δύο επόμενες μελέτες, οι οποίες δημοσιεύτηκαν και οι δύο στο bioRxiv, οι κριτικοί παρουσίασαν στοιχεία ότι οι υποτιθέμενες χίμαιρες ανθρώπινων και ιικών ιχνών DNA δημιουργούνται συνήθως από την ίδια την τεχνική που η ομάδα χρησιμοποίησε για να τα σαρώσει σε χρωμοσώματα. Ως μία έκθεση κατέληξε στο συμπέρασμα, οι αλληλουχίες ανθρώπινου ιού «είναι πιθανότερο να είναι ένα μεθοδολογικό προϊόν, [sic] από το αποτέλεσμα της πραγματικής αντίστροφης μεταγραφής, ολοκλήρωσης και έκφρασης».
Στη νέα τους εφημερίδα, ο Jaenisch, ο Young και οι συνάδελφοί του αναγνωρίζουν ότι η τεχνική που χρησιμοποίησαν κατά λάθος δημιουργεί ανθρώπινες-ιικές χίμαιρες. «Νομίζω ότι είναι ένα σωστό σημείο», λέει ο Jaenisch. Προσθέτει ότι όταν υπέβαλαν για πρώτη φορά το έγγραφο σε ένα περιοδικό, ήξεραν ότι χρειάζονταν ισχυρότερα δεδομένα, τα οποία ήλπιζαν να προσθέσουν κατά τη διαδικασία αναθεώρησης. Ωστόσο, το περιοδικό, όπως πολλοί, απαιτεί από τους συγγραφείς να δημοσιεύουν αμέσως όλα τα αποτελέσματα COVID-19 σε έναν διακομιστή προεκτύπωσης. «Πιθανότατα θα έπρεπε να σου πω, δεν θα το βάλω στο bioRxiv. Ήταν μια εσφαλμένη κρίση », λέει ο Jaenisch.
Στη νέα εφημερίδα PNAS , η ομάδα παρέχει στοιχεία ότι μόνο τα χειροποίητα αντικείμενα δεν μπορούν να εξηγήσουν τα ανιχνευμένα επίπεδα του χιμαιρικού DNA ιού-ανθρώπου. Οι επιστήμονες δείχνουν επίσης ότι τμήματα των στοιχείων LINE-1 πλαισιώνουν την ολοκληρωμένη ιογενή γενετική αλληλουχία, υποστηρίζοντας περαιτέρω την υπόθεσή τους. Και έχουν συνεργαστεί με έναν από τους αρχικούς σκεπτικιστές, τον Stephen Hughes του Εθνικού Ινστιτούτου Καρκίνου, ο οποίος πρότεινε ένα πείραμα για να διευκρινίσει εάν η ενσωμάτωση ήταν πραγματική ή θόρυβος, με βάση τον προσανατολισμό των ολοκληρωμένων ιογενών αλληλουχιών σε σχέση με τις ανθρώπινες. Τα αποτελέσματα υποστηρίζουν την αρχική υπόθεση, λέει ο Hughes, συν-συγγραφέας της νέας εργασίας. «Αυτή η ανάλυση έχει αποδειχθεί σημαντική», λέει.
«Τα δεδομένα ενσωμάτωσης στην κυτταρική καλλιέργεια είναι πολύ πιο πειστικά από ό, τι παρουσιάστηκε στην εκτύπωση, αλλά εξακολουθούν να μην είναι απολύτως καθαρά», λέει ο Feschotte, ο οποίος τώρα αποκαλεί την υπόθεση του Jaenisch και του Young «εύλογη». (Το SARS-CoV-2, σημειώνει, μπορεί επίσης να παραμείνει σε ένα άτομο για μήνες χωρίς να ενσωματώσει τα γονίδια του.)
Το πραγματικό ερώτημα είναι εάν τα δεδομένα κυτταρικής καλλιέργειας έχουν σχέση με την ανθρώπινη υγεία ή τα διαγνωστικά. «Ελλείψει ενδείξεων ενσωμάτωσης σε ασθενείς, το περισσότερο που μπορώ να αφαιρέσω από αυτά τα δεδομένα είναι ότι είναι δυνατό να ανιχνευθούν συμβάντα επαναφοράς του SARS-CoV-2 RNA σε μολυσμένες κυτταρικές σειρές όπου το L1 υπερεκφράζεται», λέει ο Feschotte. "Η κλινική ή βιολογική σημασία αυτών των παρατηρήσεων, εάν υπάρχουν, είναι θέμα καθαρής κερδοσκοπίας σε αυτό το σημείο."
Η ομάδα του Jaenisch και Young αναφέρουν υπαινιγμούς για την ένταξη SARS-CoV-2 στον ιστό από ζωντανούς και αυτοψία ασθενείς με COVID-19. Συγκεκριμένα, οι ερευνητές βρήκαν υψηλά επίπεδα ενός τύπου RNA που παράγεται μόνο από ολοκληρωμένο ιικό DNA καθώς το κύτταρο διαβάζει την αλληλουχία του για την παραγωγή πρωτεϊνών. Όμως, ο Young αναγνωρίζει, "Δεν έχουμε ακόμη άμεσα στοιχεία για αυτό".
Ο Harmit Malik, ειδικός σε αρχαίους ιούς στο ανθρώπινο γονιδίωμα στο Κέντρο Έρευνας για τον Καρκίνο του Fred Hutchinson, λέει ότι είναι μια «νόμιμη ερώτηση» να ρωτήσουν γιατί οι άνθρωποι που θα έπρεπε να είχαν εκκαθαρίσει τον ιό έχουν μερικές φορές θετικές δοκιμές αντίδρασης αλυσίδας πολυμεράσης για τις ακολουθίες του. Αλλά παραμένει επίσης πεπεισμένος ότι η εξήγηση είναι ολοκληρωμένος ιός. «Υπό κανονικές συνθήκες, υπάρχουν τόσο λίγα μηχανήματα αντίστροφης μεταγραφής» στα ανθρώπινα κύτταρα, λέει ο Malik.
Η διαμάχη έχει αυξηθεί σαφώς πιο αστική από τον Δεκέμβριο. Τόσο ο Young όσο και ο Jaenisch λένε ότι δέχτηκαν πιο έντονη κριτική για το προεκτύπωμά τους από οποιεσδήποτε μελέτες στην καριέρα τους, εν μέρει επειδή ορισμένοι ερευνητές ανησυχούσαν ότι έπαιξε στα χέρια των σκεπτικιστών εμβολίου που διαδίδουν ψευδείς ισχυρισμούς σχετικά με τα πρόσφατα εγκεκριμένα εμβόλια mRNA . «Αν υπήρχε ποτέ ένα προτύπωμα που πρέπει να διαγραφεί, είναι αυτό! Ήταν ανεύθυνο να το βάλουμε ως προεκτύπωση, λαμβάνοντας υπόψη την πλήρη έλλειψη σχετικών στοιχείων. Τώρα χρησιμοποιείται από μερικούς για να εξαπλωθούν αμφιβολίες σχετικά με τα νέα εμβόλια », δημοσίευσε η Marie-Louise Hammarskjöld, μικροβιολόγος στο Πανεπιστήμιο της Βιρτζίνια σε ένα σχόλιο για το bioRxiv εκείνη τη στιγμή.
Και τι γίνεται με την αρχική υποβολή περιοδικού; «Το απέρριψαν», λέει ο Jaenisch.
Δεν υπάρχουν σχόλια
Σημείωση: Μόνο ένα μέλος αυτού του ιστολογίου μπορεί να αναρτήσει σχόλιο.